De mutant Wolverine heeft zich in de Canadese wildernis teruggetrokken en treurt om zijn grote liefde Jean Grey. Daar wordt hij opgezocht door de Japanse Yukio die hem vraagt om naar Tokio te komen. Directeur Yashida ligt op sterven en wil afscheid nemen van zijn vroegere redder Wolverine. In Tokio wordt hij het slachtoffer van een complot van de arts Viper die ook bovennatuurlijke krachten heeft.
