De piloten van de torenhoge Jaeger-robots gaan opnieuw de strijd aan met kolossale en allesvernietigende monsters. De vader van Jake Pentecost, een rebelse voormalig Jaeger piloot, offerde zichzelf op om de mensheid te redden van de Kaiju monsters. Jakes zus Mako Mori is de leider van een nieuwe generatie piloten die zich verenigen tegen de dreiging. In hun voorbereiding om de grootste krijgsmacht te worden die de aarde ooit gekend heeft, werkt Jake samen met zijn rivaal, de getalenteerde piloot Lambert. Ook wordt Jake bijgestaan door de vijftienjarige Jaeger-hacker Amara.